La Comisión sistematizó el proceso de investigación para el esclarecimiento de la verdad. Con este objetivo misional se busca ofrecer una explicación amplia y profunda del conflicto armado en Colombia.
Este documento abarca varios momentos de la investigación, desde las claridades conceptuales trazadas por los documentos oficiales que dan origen a la Comisión; los resultados del despliegue territorial y los primeros ejercicios de escucha, como una etapa previa de alistamiento y, luego, las acciones realizadas en cada una de las cuatro fases de la investigación:
1) Escucha y gestión del conocimiento.
2) Análisis, contrastación y verificación de la información.
3) Elaboración y redacción del informe.
4) Divulgación y difusión del informe.
El avance de la investigación para el esclarecimiento nunca fue lineal. Desde la puesta en marcha de los primeros ejercicios de escucha hasta el análisis y la contrastación, muchas de las acciones se llevaron a cabo de manera simultánea y sus resultados retroalimentaron la toma de decisiones posteriores. Todo ello enriqueció la forma en que se desarrollaron los diversos instrumentos metodológicos y se fueron ajustando las orientaciones para la escritura del Informe Final. En la siguiente gráfica se muestran los grandes hitos de este proceso.